Annak ellenére, hogy a szlovák-magyar politikai kapcsolatok problémákkal telítettek, a két ország gazdasági kapcsolata folyamatos előrehaladást mutat.

Az utóbbi 11 évben csupán egy olyan esztendő volt, amikor az előző évhez képest hanyatlás volt a szlovák-magyar kereskedelemben. Ez 2009-ben volt, ami inkább magyarázható a világgazdaság helyzetével, mintsem a két ország közötti kapcsolatokkal.
Magyarország exportmérlege Szlovákiával szemben pozitív, a kivitel meghaladja a behozatalt - ez 2005-től van így.
Magyar szemszögből nézve az export-import számadatai 2001-től kezdve a Központi Statisztikai Hivatal tájékoztatása szerint a következők voltak:

2001: 118,0 - 172,9; 2002: 127,9 - 175,2; 2003: 189,9 - 204,6; 2004: 216,8 - 243,3; 2005: 355,5 - 298,3; 2006: 605,8 - 449,9; 2007: 727,3 - 528,3; 2008: 876,3 - 654,5; 2009: 825,3 - 651,6, 2010: 1053,1 - 754,9, 2011: 1201,5 - 1000,8 - (adatok milliárd forintban)